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核酸码采集终端一体机一般放置在采样操作的桌面上，也可以固定在采样窗台上。进行采样时医疗人员应先根据采样任务（单人单管、五人一管、十人一管、十五人一管或二十人一管）的要求在核酸码采集终端一体机上进行相对应的选择，然后对试管条码进行扫描；接着受检人员上前向核酸码采集终端一体机出示核酸采样码或身份证，核酸码采集终端一体机可在一秒内完成信息的读取与上传；最后由医疗人员为受检人员进行鼻拭子或咽拭子，在完成既定人数采样后，核酸码采集终端一体机会自动结束这管试剂的数据录入并实时上传平台系统。此时，医疗采样人员只需要拿出新的试管扫码即可开启新管进行下一轮采样。